传说永清县北钊是燕王讨北招兵买马之地。清真寺始建于明朝，1819年永定河发大水被淹。

1909年重建新寺。本村回族田玉辛(人称田五巴巴)在京城开“三元店”和“宾乐店”，为建清真寺在民间和官方筹集了大量资金和原料。该寺建造三年， 占地三亩。

建成后，田五巴巴在京城请来圣旨金匾一块，悬在殿内北墙正中，其两侧金匾均为知名人士所赠。现清真寺内存有古代汉白玉香炉托一个，直径为一米，此外门前还保留着两个汉白玉狮子。